 |
Ponencia |
 |
| |
Secuenciación y análisis del transcriptoma de dalbulusmaidis
Por:
Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires
Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires
Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires
Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires
Publicado en:
 |
|
Resumen:
Español
Los auquenorrincos (chicharritas o cotorritas) son insectos exclusivamente fitófagos, que pueden
causar importantes daños económicos sobre los cultivos. Una de las enfermedades vectorizadas
por ellos es el achaparramiento del maíz o Corn Stunt Disease, potencialmente una de las
enfermedades más serias del cultivo de maíz, capaz de causar pérdidas parciales o totales en la
producci ón en las zonas afectadas. En Argentina, Dalbulusmaidis (Hemiptera: Auchenorrhyncha)
es el único vector a campo conocido como transmisor del Spiroplasmakunkelii , patógeno causal
del Corn Stunt . Dada su importancia como plaga en la agricultura, se secuenció el transcriptoma
de todos los estadios del ciclo de vida de este insecto (huevos, 5 estadios ninfales y dos muestras
de adultos). Se utilizó un pool de insectos para abarcar la mayor cantidad de genes expresados.
Como la información genómica de Dalbulusma idis no está disponible, se realizó el ensamblado de
novo . Se compararon los ensambles realizados con 3 programas: VELVET OASES, ABySS y
Trinity. Se evaluaron utilizando métricas (N50, longitud de contig ) y medidas de cobertura (CEG,
BUSCO). En base a es tosanálisis, se decidió buscar genes del desarrollo en los ensambles de
VELVET OASES y Trinity. El porcentaje total de genes encontrado fue mayor para el ensamble
de Trinity. Teniendo en cuenta los resultados previos, se ensamblaron el resto de las muest ras con
Trinity, obteniendo valores de métricas y coberturas muy buenos. Además se compararon los
transcriptomas con proteomas publicados como medida de homología entre especies. En este
trabajo se compararon distintos métodos de ensamble de novo y se selec cionó el que mejor se
adaptó a nuestros datos y experimentos
Disciplinas:
Ciencias e Investigación - Tecnología
Palabras clave :
Transcriptoma de Dalbulusmaidis
Descriptores:
INSECTOS FITÓFAGOS - PLANTAS COMESTIBLES PARA FITÓFAGOS - MAÍZ - MONITOREO DE PLAGAS - BIOINFORMÁTICA
Cómo citar este trabajo:
Palacio, Victorio Gabriel; Lavore, Andrés; Catalano, María Inés ; Rivera Pomar, Rolando .
(2018).
Secuenciación y análisis del transcriptoma de dalbulusmaidis.
Ponencia
Mendoza, .
Dirección URL del informe: /13053.
Fecha de consulta del artículo: 02/12/24.
|
|
 |
|
 |
|
|
|
Fichas descriptivas de las especies del jardín botánico en la Fac. de Ciencias Agrarias.
Selección de trabajos alrededor de la temática de los Derechos Humanos en la Argentina y en Mendoza en particular.
Una selección de artículos, tesis, informes de investigación y videos sobre temáticas de la vid, la vinificación, la economía y la cultura del vino mendocino
Espacio virtual que pone a disposición tesis doctorales y trabajos finales de maestría de posgrados dictados en la Facultad de Filosofía y Letras de la UNCuyo.
En este sitio se pueden consultar las tesis de grado de la Facultad de Cs. Económicas de la UCuyo. La búsqueda se puede hacer por autor, titulo y descriptores a texto completo en formato pdf.
|
| //DOSSIERS ESPECIALES |
|
Cada Dossier contiene una selección de objetos digitales en diversos formatos, bajo un concepto temático transversal.
La propuesta invita al usuario a vincular contenidos y conocer los trabajos que la UNCuyo produce sobre temáticas específicas.
|
| |
| Para la correcta utilización de todos los materiales de esta biblioteca es necesario que disponga de: |
 |
 |
|
